在宝可梦与人类共存的现代校园中，普通高中生林澈意外觉醒能与宝可梦心灵共鸣的能力。表面是优等生的他，夜晚却以“幽影”为代号，潜入黑暗组织解救被囚禁的宝可梦。当神秘杀手“夜枭”开始追杀所有异能者时，林澈发现自己的能力竟与二十年前灭世的“超梦之乱”有着惊人关联。在暴烈兽搭档雷克斯的守护下，他被迫与傲娇御姐训练师叶燃、黑客天才雾岛组成小队，穿梭于霓虹闪烁的学院都市与危机四伏的荒野秘境。随着剧情推进，林澈逐渐揭开自己作为“超梦碎片容器”的真相，而看似对立的杀手组织竟藏着拯救宝可梦世界的终极计划……
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在宝可梦与人类共存的现代校园中，普通高中生林澈意外觉醒能与宝可梦心灵共鸣的能力。表面是优等生的他，夜晚却以“幽影”为代号，潜入黑暗组织解救被囚禁的宝可梦。当神秘杀手“夜枭”开始追杀所有异能者时，林澈发现自己的能力竟与二十年前灭世的“超梦之乱”有着惊人关联。在暴烈兽搭档雷克斯的守护下，他被迫与傲娇御姐训练师叶燃、黑客天才雾岛组成小队，穿梭于霓虹闪烁的学院都市与危机四伏的荒野秘境。随着剧情推进，林澈逐渐揭开自己作为“超梦碎片容器”的真相，而看似对立的杀手组织竟藏着拯救宝可梦世界的终极计划……