2027年,人类社会正式承认数碼兽的存在,它们与人类的共生关系渗透至全球各个领域。主角平清一,一个怀揣传奇梦想的青年,立志成为史上最伟大的馴兽師。在导师和田老师的指导下,他结识了搭档日冕兽——一只拥有太阳般炽热力量却性格傲娇的数碼宝兽。随着人类与数碼世界矛盾的激化,平清一被迫卷入「二十五年前神秘事件」的真相追寻,从底层馴兽師逐步成长为谈判桌上的人类代表。 故事以「人类与数碼宝兽的最终谈判」为高潮,揭露数碼世界与现实时空重叠的危机。平清一带领团队穿梭于数据深渊与现实战场,利用数碼兽的进化之力对抗失控的暴走暴君兽军团。在最终决战中,日冕兽突破极限进化为究极形态,而和田老师隐藏的「初代被选召者」身份浮出水面。结局并非简单的胜利,而是人类与数碼兽达成「新共生契约」,平清一在废墟上建立的「数码驯兽学院」成为连接两个世界的桥梁。