在《穿越者杀死》中，主角意外发现自己身处一个全民沉迷“无限流”和“穿越游戏”的世界。当所有人都在追逐热血的副本挑战或浪漫的异世冒险时，主角却被迫绑定了一个令人窒息的职业——“穿越者杀手”。他的任务是潜入各个时空，猎杀那些因游戏失控而滞留现实世界的穿越者。随着剧情展开，主角逐渐发现这些穿越者并非简单的NPC，他们中有人背负着原世界的秘密，有人试图篡改历史，甚至有人与主神系统存在千丝万缕的联系。 在一次次生死任务中，主角不仅要对抗穿越者的超能力，还要面对系统发布的“道德困境”：例如，拯救一个可能成为未来领袖的穿越者，或是摧毁一个即将引发时空崩塌的异界文明。与此同时，他结识了自称“时空管理局叛徒”的神秘搭档、拥有读心术的反派穿越者，以及试图破解主神代码的黑客组织。当主角发现自己的记忆被多次篡改，而所谓的“职业”竟是主神系统为掩盖真相设计的陷阱时，他必须在毁灭所有穿越者与拯救多元宇宙之间做出抉择……